Hola JPG.
Yo en esto de la fotografía soy un aficionado desde hace unos cuantos años pero no soy ningún profesional, te doy mi opinión.
Antes de nada, prueba con tu cámara hasta que ISO te aguanta, es decir, cuál es el valor máximo al que la fotografía sigue saliendo con una calidad óptima y no se produce "el ruido" o grano.
El tiempo de exposición no influye en ningún factor que no sea en dar luz a la fotografía. No es como el diafragma, que además de regular la mayor o menor entrada de luz, valores bajos de éste (diafragma muy abierto) va a hacer que tengamos muy poca profundidad de campo y viceversa.
En cuanto a la distancia focal, también incidirá, y más que el diafragma en la profundidad de campo. A mayor distancia focal menor profundidad de campo.
Y no hay una norma sobre qué es mejor y peor, sino simplemente lo que quieras conseguir, que en el caso de la fotografía a las setas entiendo que puede ser una profundidad de campo media para que se observe un poco el hábitat.
Te cuento esto porque la elección de pongo más ISO o más tiempo de exposición es un factor que se determina en función de la circunstancia. Yo generalmente pongo un ISO fijo en función del día y juego con diafragma y el tiempo de exposición. Sólo vuelvo a cambiar el ISO si la fotografía y las circunstancias lo requieren (por ejemplo hay poca luz, no quiero abrir el diafragma a tope y como ponga menos tiempo de exposición me va a salir movida porque no tengo el trípode), pues subo el ISO.
El trípode está muy bien para momentos con poca luz, salir tú en la foto o en cámaras con pantallas giratorias ver la fotografía sin necesidad de agacharte y estar incómodo, pero hay que cargar con él.
A mí el flash tampoco me gusta porque a mis ojos crea el efecto como de un plano......
Espero haberte ayudado